提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
油价迎2023年首跌 春节前后驾车出行将更便宜******
中新网1月17日电(中新财经 葛成) 据国家发改委通知,1月17日24时起,每吨汽油下调205元,每吨柴油下调195元。
本轮是国内油价2023年第二次调价,调价后,成品油年内呈现“一涨一跌”格局。两次调价涨跌抵消后,汽、柴油累计每吨均上调45元,基本回归至2022年底水平。
资料图:加油站。 中新财经 葛成 摄由于本次调价临近春节,车主春节前后驾车返乡、走亲访友的路费将进一步降低。
机构测算,此次调价折合92号汽油每升下调0.16元,95号汽油每升下调0.17元,0号柴油每升下调0.17元。
以油箱容量50L的普通私家车为例,这次调价后,车主加满一箱油将少花8元左右。柴油方面,油箱容量为160L的大货车,加满一箱油将少支出约27.2元。
隆众资讯分析师刘文杰认为,本轮计价周期内,国际油价偏弱震荡。虽然美国通胀压力持续缓和,美联储加息力度或进一步放缓,亚洲局部需求亦正在稳步恢复,但伊朗原油出口量在去年最后两个月创2019年以来新高,北半球相对温暖的气温也减少了燃料取暖需求,短线供应较为充裕。
“整体来看,计价周期内挂靠油种均价下移,所对应的原油综合变化率负向区间运行,开启本轮零售价下调窗口。”
下一轮国内成品油调价窗口将在2月3日24时开启。
“预计下一轮成品油调价上调的概率较大。”隆众资讯分析师李彦分析称,以当前的国际原油价格水平计算,下一轮成品油调价开局将呈现上涨的趋势。目前来看,美国通胀压力持续放缓,美联储加息力度降至25个基点是大概率事件,叠加中国及亚洲需求持续复苏,需求前景有所改善。
“下轮计价周期来看,国际油价短期内走势偏强运行。上调预期方向将继续支撑市场,消息面支撑仍存。”金联创成品油分析师马建彩亦持相同观点。(完)
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